Mascot
英國 Matrix Science 公司所研發的 Mascot 蛋白質資料庫鑑定軟體，利用質譜的圖譜與資料庫序列進行比對來鑑定蛋白質。是目前全球蛋白質體質譜用戶最熟知、也最廣泛使用的一套資料搜尋系統。包括全台灣各大蛋白質體核心實驗室，也多以 Mascot 作為蛋白質鑑定報告的系統。
適合應用領域
►DDA proteomic
►Protein ID
►Protein PTM
功能特色
- 提供各種搜尋模式 (Peptide mass fingerprint、Sequence Query 、 MS/MS Ion search) 。
- 可支援各大質譜廠牌檔案格式。
- 能搜尋各式 Fasta 資料庫 (1.MSDB、NCBInr、SwissProt, Genomic DNA) ，或使用者可自行建立database比對的功能。
- 獨特的應用統計分析為基礎，以真實的概率分數提高鑑定可信度。
- 數據處理快速，提供單一或多處理器系統同步分析，達到更高生產量
- 適用各大電腦軟硬體系統。
- 功能多樣的擴充性 (Daemon, Cluster, Integra, Parser, Distiller,.......) 。
- 一直致力於發展的軟體，提供最先進的生物資訊學。
►提供各種搜尋模式做蛋白質鑑定
►單一介面設定所有搜尋參數，無繁雜的設定介面
►蛋白質鑑定結果，可輸出多種報告格式
Distiller Workstation
Mascot distiller 做為一個工作站，核心功能是來瀏覽各種 MS 質譜檔案，並以獨特的演算法來處理質譜數據，產生高品質的peak lists，藉由使用以下不同的 Toolbox 可擴展原有的核心功能。
► Daemon Toolbox : 讓Distiller可以連接Daemon設定排程，自動進行數據的批次處理
► Search Toolbox: 可檢視Mascot 的比對結果，以及進行 de novo sequencing。
► Quantitation Toolbox: 可進行以 MS1 為基礎的定量(例如:label-free , SILAC…等等)。
► Developer Toolbox: 讓使用者可以使用應用程式開發介面，來開發應用程式強化固有功能。
功能特色
- 提供各種搜尋模式 (Peptide mass fingerprint、Sequence Query 、 MS/MS Ion search) 。
- 可支援各大質譜廠牌檔案格式。
- 能搜尋各式 Fasta 資料庫